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指能将质子从细胞膜的一侧泵至另一侧而形成跨膜质子浓度梯度的作用。现已证明嗜盐菌紫膜在日光照射下，能将质子从膜内泵至膜外，具有质子泵功能。此外，质子泵作用和质子浓度梯度亦存在于线粒体内膜和叶绿体类囊体膜中。
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